Madeleine Isaksson étudie à l’Ecole Supérieure de Musique de Stockholm où elle obtient le diplôme de professeur de piano, puis de composition. Munie de deux diplômes, elle part à l'étranger pour poursuivre ses études de composition, en passant par une année à Amsterdam, jusqu'à Paris où elle vit et travaille comme compositrice depuis lors.
Madeleine compose pour divers formations instrumentales et vocals, ainsi que pour orchestre.
Sa musique peut être caractérisée par une concentration dramatique interne et l’expression de l’intime, une métrique fluctuante sensible aux lois de la gravitation. Les relations sont au premier plan, entre les différentes sources de timbres, ce qui les sépare, ce qui les fond. Les cadres initiaux peuvent être décrits comme des espaces: espaces d'intervalle, de registre et du temps, où le matériau se développe par le biais de termes opposés. Des cellules mélodiques répétées sont rétrécies, agrandies et combinées. Ensemble elles créent une sorte de dessin élastique, lié à une pulsation parfois perceptible, parfois dissimulée.
En 2016-2017, elle est compositrice en résidence à l'Orchestre symphonique de Gävle avec deux compositions : Bridges and Ljusrymd.
En 2012 elle obtient le prix Saltö pour son œuvre solo Les sept vallées, flûtes à bec.
En 2019, elle est éluée membre de l'Académie suédoise de musique et a reçoit la même année le prix Rosenberg de l'Association des compositeurs suédois (FST) avec la motivation :
"La musique de Madeleine Isaksson se caractérise par un travail minutieux et un intérêt pour les univers sonores uniques des instruments acoustiques. Elle reçoit ce prix pour de nombreuses années de production polyvalente et originale, caractérisée par une intégrité artistique élevée et sans compromis."
En 2021-23, plusieurs oeuvres ont été créés:
quatre solos: Écrits sur l'eau pour piano, Tjälen går ur jorden, pour violon, Span pour orgue et Fält pour violoncelle, les ensembles Capsuled Time et Infilitrations, le mouvement orchestral Flows, le quintet Graphe pour percussion, et recemment le quatuor d'hautbois Vindande.
Au printemps 2024, un nouveau CD personnel de sa musique de chambre, Infiltrations, interprété par l'ensemble Gageego! sortira chez Footprints Records.
La musique de Madeleine Isaksson est régulièrement commandée et interprétée par des musiciens, des ensembles et des orchestres de renommée internationale lors de concerts et de festivals en Europe, en Amérique et en Asie.